据中国之声《央广新闻》报道，杭州三年之后将引千岛湖水，然而每年还有3600万吨左右生活污水排入千岛湖。有关人士呼吁，在杭州引水工程中，增加管道用于专门排放生活污水。
现在千岛湖沿线包括周边都有一些居民企业还有村庄，这些村庄是大部分非常分散的，会出现一个问题，就是生活污水没法处理，这样一来很多生活污水就直接排放到千岛湖当中去，还有一些企业也会出现把污水排放到千岛湖当中，这些污水排放之后，都是靠湖水自身来净化的。但是水质肯定会发生变化，现在整个千岛湖是处于平营养化，如果持续这样，不采取任何措施和办法的话，就会跨入到重营养化的当中。
千岛湖的水域大部分分布在淳安、和县这两个地方，当地也是采取了很多的办法，从五个方面保护。采砂，网箱养殖、垂钓、船舶生活污水和农村生活污水集中处置。
第一，工业企业方面，很多工业企业都关停并转了。一些化工建筑污染比较严重的企业都集中到一起，污水进行统一的处理之后，达到标准进行排放。还有一些小小水电企业，小电路行业就直接把它关停了。针对千岛湖周边有一些采砂无序的现象，当地也是进行了像定点定时定量的办法科学进行采砂，对它进行严厉的监管。
第二，很多人仍然是以船舶的方式生活在这个千岛湖上，污水肯定是直接排放到千岛湖当中的，这样一来对水质会造成污染。对这个现在也是实现了千岛湖船舶生活污水零排放，让他们都上岸了。
第三，网箱整治主要是包括淳安和建德，如果是以前我们坐船到亲千岛湖当中会看到很多湖面上有网箱，但现在看不到这样的情况了，两个地方也是下了铁的决心，花了很多的资金和精力，使它们全部都上岸。现在还有一小部分，协议已经签了，现在因为大量的鱼还没有处理掉未上岸，但已经令他们限期上岸。
第四，居民区的污染，当地06年就启动了清洁乡村，在这个工作当中，首先最开始做的就是农村的无害化厕所的建立，还有就是农村的灭源污染的整治。
