据筹建中的合肥市排水管理办公室工作人员介绍，南淝河中上游段（环湖东路——当涂路桥）17.3公里截污及水质项目，按照“截污、清淤、赋氧、补水、河道生态建设”的总体思路，规划设计一次到位，分步组织实施。第一阶段从2007年至2008年，实施截污、泵站新建及改造工程，实现污水不入河，基本消除河道水体黑臭现象，提高水体透明度，初步恢复河道生态环境。第二阶段从2009年至2010年，实施河道综合生态治理，包括清淤、赋氧、补水、生态浮床建设，进一步提高水体自净能力，使南淝河水质提高到Ⅴ类，甚至更高标准，水环境状况将得到明显改善。目前，南淝河合作化路桥以上2.1公里段污水截流管已于7月中旬开工建设。
3年内，合肥市南淝河水质将达到Ⅴ类标准，即水质达到适用于农业用水及一般景观的要求。近日，南淝河截污及水质改善项目可行性研究通过专家评审，在未来的3年里，合肥市排水部门将采取“截污、清淤、补水、赋氧及河道生态建设”的五大治理方案，对南淝河污染问题进行全面综合整治。
